有機肥設備施工時，大部分是利用有機廢棄物和易腐物質。所以原材料的存留地和儲藏地卸貨時都會產生臭氣。另外在原材料、輔料、堆肥的放置場地以及搬運車出入的發酵設施間的平臺等。會產生粉塵和難聞的氣體。

　　在使用有機肥設備中的粉碎機粉碎稻殼時，當粉碎了的稻殼搬運進行搬運時，也會產生粉塵和水蒸氣。在粉碎剪枝時，若使用剪切式粉碎機基本不會產生粉塵，但若以高速回轉式粉碎和空氣輸送兼用的方式粉碎剪枝，則會產生相當量的粉塵和噪聲。在混合設備中，將各種原材料投入混合機，特別是在含水量小的堆肥返料和混合原材料的排出時，也會產生臭氣和粉塵。

　　經過向發酵設施中投入原材料，并通過發酵設施將堆肥排出，在二次發酵槽進行反復作業等過程中，臭氣和粉塵。有機物的分解會使原材料溫度上升，并產生大量的水分。重復作業的過程中就會把水蒸氣、粉塵和氣體混合在一起，導致有機肥設備發酵室內呈現白霧的狀態。